Les plantes, tout comme les animaux, sont sujettes à de nombreuses maladies dues principalement à des champignons, des bactéries ou des virus. Elles sont généralement décrites par les symptômes occasionnés sur le végétal. Ces premières observations ayant été faites longtemps avant la découverte de la microbiologie, on se retrouve aujourd’hui avec des maladies dont les pathogènes incriminés sont totalement différents selon les espèces végétales attaquées. A cette complexité peut également s’ajouter d’autres symptômes dues à des carences. On peut ainsi prendre l’exemple de la nécrose apicale de la tomate, qui est plus connue sous le nom de maladie du cul noir.  

D’un point de vue global on peut distinguer des maladies généralistes qui vont toucher un large panel de cultures et d’autres plus spécifiques qui au contraire seront inféodées à un faible groupe de familles botaniques voir même à une seule espèce végétale. 

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